Fabuła „Beyond Skyline” rozgrywa się równolegle do „Skyline”, ale w innym miejscu na świecie. Gdy następuje inwazja kosmitów, twardy detektyw Mark (Frank Grillo) wyrusza, by odzyskać swojego syna, Trenta (Jonny Weston). Znajduje się on na pokładzie statku kosmicznego razem z innymi ludźmi porwanymi podczas ataku.