Gyakusatsu Kikan opowiada o czasie w którym eksplodował wojenny terror – dokładniej od momentu zniszczenia Sarajewa ręcznie zbudowaną bombą atomową.
Wiodące demokracje przekształciły się w państwa policyjne a świat rozwijający się utonął w fali ludobójstwa.
Za upadek światowego systemu wydaje się być odpowiedzialny amerykanin znany jako John Paul a agent wywiadu Clavis Shepherd ma za zadanie wyśledzić domniemanego sprawcę wśród ruin cywilizacji – oraz znaleźć prawdziwe serce ciemności – narząd (organ) ludobójstwa.