Gdy jedynka próbuje dokonać egzekucji Baala ostatniego władcy systemu. Teal’c i Vala w tajemniczy sposób znikają…. Samantha, Daniel i Mitchell cofają się do przeszłości a mianowicie do świata gdzie historia została zmieniona: program Stargate została wymazana z historii. Kiedy załoga próbuje przekonać władze o tym co się stało, na orbicie Ziemi pojawiają się statki Goa’uld pod wodzą przebiegłego Baala i jego królowej Katesh i Teal’c-a. Jedynka musi odnaleźć wrota i naprawić stan rzeczy zanim Ziemia zostanie podbita przez Goa’uld.