Film oparty na Anime Gundam Seed. 70 rok Ery Kosmicznej. Drobne tarcia pomiędzy genetycznie zmodyfikowanymi ulepszonymi ludźmi (Koordynatorami) a „zwykłymi śmiertelnikami” (Natralnymi) przerodziły się w poważny konflikt. Sojusz Ziemski na neutralnej kolonii kosmicznej skonstruował pięć robotów bojowych – Gundamów, aby dogonić bardziej technologicznie rozwiniętych Koordynatorów. W wyniku nieprzewidzianych zdarzeń, młody Koordynator, Kira Yamato uciekający przed wojną staje się pilotem Strike Gundama – jednego z robotów skonstruowanych przez Sojusz Ziemski. Kira musi odnaleźć się w nowej sytuacji i stawić czoła ludziom ze swojej „rasy” aby ochronić swoich przyjaciół.