Kiedy nieznana, obca siła niszczy kilka klingońskich statków, James T. Kirk (William Shatner) powraca na kapitański mostek zmodernizowanego U.S.S. Enterprise. Leonard Nimoy, DeForest Kelley oraz załoga z oryginalnej telewizyjnej serii „Star Trek” mobilizuje siły, abo powstrzymać niszczycielskie zapedy obcego intruza nieubłaganie zmierzającego z stronę Ziemi.