Film to pełna tajemnic i niebezpieczeństw wyprawa w głąb amazońskiej dżungli, którą odbywają szaman Karamakate i dwóch białych naukowców. Poszukują yakruny – rośliny, która jest remedium na wszystkie choroby. Ich wyprawa trwa 40 lat i zamienia się w pełną sekretów podróż do jądra ciemności, którym stała się rzeczywistość kolonizowanej Amazonii.