Film powstał w oparciu o życie Ziada Jarraha, jednego z terrorystów, który pilotował samolot biorący udział w zamachu 11 września 2001 roku. Akcja filmu „Żona pilota” rozpoczyna się w latach 90. XX wieku w Hamburgu, gdzie Asli Bilgin spotyka przystojnego i charyzmatycznego Saeeda Awada. Młodzi ludzie zakochują się w sobie od pierwszego wejrzenia. Wkrótce biorą ślub w tajemnicy przed matką dziewczyny, która jest przeciwna ich związkowi. Nadchodzi rok 2000. Szczęśliwa dotąd Asli dostrzega zmianę w zachowaniu męża, który głosi coraz bardziej radykalne poglądy. Czuje, że coś przed nią ukrywa. Jakiś czas później Saeed informuje żonę, że musi na długo wyjechać….